Instalacja nowego oprogramowania
Dostępność oprogramowania oraz wymagania dla instalacji nowych programów na komputerach ICM opisane są tu. Ze względów bezpieczeństwa, administratorzy nie mogą instalować mało rozpoznawalnego i słabo udokumentowanego oprogramowania w systemie.
W takiej sytuacji użytkownik może zainstalować program lokalnie, na swoim koncie.
Ogólna procedura
Aplikacje różnią się między sobą. Poniższa, ogólna procedura może stanowić punkt startowy.
Ściągnięcie kodu źródłowego
wget https://somewhere.com/archive.tar.gz
tar -zxvf archive.tar.gz
# lub
git clone https://github.com/somewhere/something.git
Instalacja programu w lokalnym katalogu
Instalacja programu w lokalnym katalogu użytkownika, np. $HOME/myapps.
cd extracted_archive
make configure
./configure --prefix=$HOME/myapps
make
make install
Dodatek - zmienna $PATH
Aby nie musieć każdorazowo wpisywać pełnej ścieżki do programu w celu jego uruchomienia, można zmodyfikować systemową zmienną $PATH.
Więcej w Google: How to set your $PATH variable in Linux
-
https://unix.stackexchange.com/questions/26047/how-to-correctly-add-a-path-to-path
-
https://linuxize.com/post/how-to-add-directory-to-path-in-linux/
Różne systemy mogą mieć ustawione różne domyślne powłoki.
echo "$SHELL"
/bin/tcsh # topola i okeanos
/bin/bash # rysy
Przykładowo, jeżeli korzystamy z powłoki bash, to należy zmodyfikować plik ~/.bashrc
export PATH=$PATH:$HOME/myapps/application_XYZ/place_with_the_file
Plik ten wczytywany automatycznie w trakcie ładowania powłoki bash
(np. podczas logowania - o ile bash jest ustawiony jako domyślna powłoka).
Aby nie logować się ponownie, wystarczy wczytać plik ~/.bashrc.
$ source ~/.bashrc
Celem ćwiczenia, użytkownik może dodać poniższe linie do pliku ~/.bashrc
alias say_something='/usr/bin/echo '
alias say_hello_user="say_something hello ${USER}"
Następnie można sprawdzić działanie nowych skrótów:
[someone@hpc ~]$ say_hello_user
say_hello_user: Command not found.
$ source ~/.bashrc
... some errors - powłoka tcsh nie interpretuje niektórych komend bash'a
[someone@hpc ~]$ bash -l
[someone@hpc ~]$ say_something blahblah
blahblah
[someone@hpc ~]$ say_hello_user
hello someone
Dla innych powłok procedura jest podobna.
Chcąc zmienić powłokę należy wpisać bash | tcsh | ksh w linii poleceń.