RedMD

RedMD w ICM
Produkt: RedMD
Producent:
Licencja: GPL
Wersja: wersja:=2.2
Email: redmd@icm.edu.pl
Lista oprogramowania

RedMD (Reduced Molecular Dynamics) to stworzony i rozwijany w Laboratorium Maszyn Biomolekularnych pakiet dynamiki molekularnej dedykowany symulacjom dużych układów molekularnych w oparciu o modele gruboziarniste.

RedMD umożliwia prowadzenie symulacji dynamiki molekularnej (NVE i NVT), stochastycznej dynamiki Langevin'a i dynamiki brownowskiej oraz globalnej optymalizacji metodą Monte Calo. Zawiera także narzędzia analizy drgań normalnych.

Pakiet został zaimplementowany w językach C i C++. Wykorzystanie technologii OpenMP umożliwia równoległe uruchamianie RedMD na wieloprocesorowych architekturach o pamięci współdzielonej. Dostępna jest również wersja wykorzystująca MPI na klastry obliczeniowe.



Źródła pakietu RedMD są dostępne tutaj:

pakiet RedMD

Można także zapoznać się z dokumentacją:

RedMD dokumentacja



Zespół RedMD udzieli odpowiedzi na wszelkie pytania związane z instalacją i wykorzystaniem pakietu.