Projekt G30-2


Granty



Informacje o projekcie

  • Numer: G30-2
  • Tytuł: Przewidywanie struktury oraz funkcji dla niescharakteryzowanych rodzin białkowych
  • Kierownik: dr Krzysztof Ginalski ()
  • Data otwarcia: 2006-04-07

Lista realizatorów

  • Krzysztof Ginalski (ICM UW)
  • mgr Andrzej Kudlicki (CAMK PAN)
  • dr Joanna Sasin (ICM)
  • dr Dariusz Plewczyński (ICM)
  • mgr Lukasz Knizewski (ICM)
  • Kamil Steczkiewicz ()
  • student Rafał Augustyniak (Wydział Farmaceutyczny, Akademia Medyczna w Warszawie)
  • dr Leszek Rychlewski (BioInfoBank)
  • Krzysztof Kuchta ()
  • mgr Jan Kutner ()
  • Michał Grzywacz (MISMaP)
  • Michał Jakub Łażniewski (Wydział Farmacji)
  • Joanna Krwawicz (IBB PAN)
  • student Maciej Dziubiński ()
  • mgr Tomasz Włodarski (ICM)
  • dr Małgorzata Rowicka-Kudlicka (ICM)
  • student Piotr Górski (MIM UW)
  • mgr Piotr Stępniak (ICM)

Streszczenie

Lista publikacji

  • The RPSP: Web server for prediction of signal peptides, Plewczynski, D., Slabinski, L., Tkacz, A., Kajan, L., Holm, L., Ginalski, K., Rychewski, L., Polymer, 2007, 48, (5493-5496)
  • Target specific compound identification using a support vector machine, Plewczynski, D., von Grotthuss, M., Spieser, S.A., Rychewski, L., Wyrwicz, L.S., Ginalski, K., Koch, U., Comb Chem High Throughput Screen, 2007, 10, (189-196)
  • In silico prediction of SARS protease inhibitors by virtual high throughput screening, Plewczynski, D., Hoffmann, M., von Grotthuss, M., Ginalski, K., Rychewski, L., Chem Biol Drug Des, 2007, 69, (269-279)
  • Modelling of potentially promising SARS protease inhibitors, Plewczynski, D., Hoffmann, M., von Grotthuss, M., Knizewski, L., Rychewski, L., Eitner, K., Ginalski, K., Phys Condens Matter, 2007, 19, (1-18)
  • Bacterial DUF199/COG1481 proteins including sporulation regulator WhiA are distant homologs of LAGLIDADG homing endonucleases that retained only DNA binding, Knizewski, L., Ginalski K., Cell Cycle, 2007, 6, (1666-1670)
  • Realm of PD-(D/E)XK nuclease superfamily revisited: detection of novel families with modified transitive meta profile searches, Knizewski, L., Kinch, L.N., Grishin, N.V., Rychlewski, L., Ginalski, K., BMC Struct Biol, 2007, 7, (40)
  • SelT, SelW, SelH, and Rdx12: genomics and molecular insights into the functions of selenoproteins of a novel thioredoxin-like family, Dikiy, A., Novoselov, S.V., Fomenko, D.E., Sengupta, A., Carlton, B.A., Cerny, R.L., Ginalski, K., Grishin, N.V., Hatfield, D.L., Gladyshev, V.N., Biochemistry, 2007, 46, (6871-6882)