Gamess

Gamess Gordon Research Group Na licencji: darmowa Lista aplikacji

GAMESS (ang. The General Atomic and Molecular Electronic Structure System) to wszechstronny pakiet do obliczeń chemii kwantowej. Program jest rozwijany przez członków Gordon research group na Uniwersytecie Stanowym Iowa.

Skrócona lista możliwości programu obejmuje:

  • Hamiltonian ab initio (z możliwością użycia wszystkich powszechnie stosowanych baz funkcyjnych, włącząjac w to efektywne potencjały rdzenia ECP), oraz półempiryczne hamiltoniany MNDO, AM1, PM3.
  • Funkcja falowa w przybliżeniu Hartree-Focka (RHF, ROHF, UHF), uogólnionej metody wiązań walencyjnych (GVB), wielkonfiguracyjnym (CI, MCSCF). Istnieje też możliwość uwzględnienia korelacji dynamicznej na poziomie metody Moellera-Plesseta (MP2 i MP4) oraz sprzężonych klastrów (CC); dotyczy to funkcji falowych RHF, ROHF, UHF, CI oraz MCSCF. Istnieje także możliwość uwzględnienia sprzężenia spinowo-orbitalnego.
  • Obliczanie własności molekularnych (ładunki populacyjne, potencjał elektrostatyczny, momenty dipolowe i wyższe momenty elektrostatyczne, polaryzowalności i hiperpolaryzowalności, gęstości spinowe).
  • Obliczanie orbitali zlokalizowanych (dla RHF i MP2).
  • Obliczanie analitycznego gradientu i hesjanu energii (nie dotyczy MP2, MP4 oraz CC).
  • Optymalizacja geometrii układu.
  • Lokalizacja stanów przejściowych.
  • Obliczanie drogi reakcji (Intrinsic Reaction Path, IRC).
  • Obliczanie prawdopodobieństw przejść.
  • Uwzględnienie efektów solwatacyjnych.

Program zawiera wiele zestawów funkcji bazowych oraz efektywnych potencjałów rdzenia, co pozwala na wykonywanie obliczeń dla cząsteczek zawierających pierwiastki od wodoru do radonu włącznie.

Dokładny opis metod stosowanych w programie znajduje się w pracy:

"General Atomic and Molecular Electronic Structure System" M.W.Schmidt, K.K.Baldridge, J.A.Boatz, S.T.Elbert, M.S.Gordon, J.H.Jensen, S.Koseki, N.Matsunaga, K.A.Nguyen, S.Su, T.L.Windus, M.Dupuis, J.A.Montgomery J. Comput. Chem., 14, 1347-63(1993).

którą należy cytować przy publikowaniu wyników uzyskanych przy wykorzystaniu programu.

Krótki spis metod zawiera poniższa tabelka:

                   Typ SCF = RHF    ROHF    UHF    GVB    MCSCF
                             ---    ----    ---    ---    -----
      energia                CDP    CDP     CDP    CDP     CDP
      gradienty analityczne  CDP    CDP     CDP    CDP     CDP
      numeryczny Hessian     CDP    CDP     CDP    CDP     CDP
      analityczny Hessian    CDP    CDP      -     CDP      -
      energia MP2            CDP    CDP     CDP     -       C
      gradient MP2           CD      -       -      -       -
      energia CI             CDP    CDP      -     CDP     CDP
      gradient CI            CD      -       -      -       -
      energia DFT            CDP    CDP     CDP     -       -
      gradient DFT           CDP    CDP     CDP     -       -
      energia MOPAC          tak    tak     tak    tak      -
      gradient MOPAC         tak    tak     tak     -       -

Legenda: C = konwencjonalne przechowywanie całek na dysku, D = bezpośrednie obliczenia całek AO, P = dostępna wersja równoległa. Pełny wykaz możliwości programu zawiera plik intro.pdf, pierwszy rozdział dokumentacji GAMESSa.

Dokumentacja

Najbardziej aktualnym źródłem informacji o GAMESSie jest strona domowa pakietu.

Główną część dokumentacji stanowi zestaw sześciu plików:

  • Wprowadzenie - intro.pdf
  • Opis formatu pliku wejściowego - input.pdf (wersja html znajduje się tutaj)
  • Przykładowe pliki wejsciowe z opisem tests.pdf
  • Lista zastosowań i odnośniki literaturowe - refs.pdf
  • Kompilacja, struktura programu. lista plików - prog.pdf
  • Informacje specyficzne dla typu maszyny - iron.pdf

Ponadto instnieje lista dyskusyjna użytkowników pakietu, na którą można zapisać się tutaj.

Użyteczne mogą być też linki:


Dostępne wersje

Gamess/2010.10.01Gamess/2012.05.01Gamess/2013.05.01

Dostępne instalacje